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回答一位家长的基因检测报告问题

  • 2022-07-10 13:08:22
  • 原创椰菜君椰菜椰
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摘   要:这份报告列出的两个基因突变,TRPM3(M1015I)和MAGEL2(R735H),到底哪个是致病元凶,还是两个都是,在这个阶段是很难做出结论的,但我们可以猜一猜。Sfari自闭症基因数据库收录了迄今为止知道的47种致病MAGEL2基因突变,其中46种都是那种导致基因完全丧失功能的移码或截断突变,只有一种(A538E)是本文提到的这种错义突变(只改变了一个氨基酸),且患者同时携带另外三种疑似致病基因突变。
关键词:自闭症,自闭症症状

文章来源:【公众号】椰菜耶;ID号:BSJ_China

有位家长私信椰菜君,想就基因检测报告得到一些帮助;但由于椰菜君怼人太多遭了报应,病倒了两天,结果这私信就不能回复了。为了维护仅有的一点正面形象,椰菜君决定在这里答复一下。

首先。。。强调一下,椰菜君不是基因研究方面的专家,也不遗传科医生,所以只能从科普的角度,尽可能通俗解释一下基因检测结果,以便家长们理解。至于深入研判和诊断,请咨询相关专业人士。

这位家长贴上来的是部分检测结果,其中有价值的部分是一个短表(隐去个人信息):


部分检测结果


这表明做了父母和孩子三人的全外显子测序,报告给出两个疑似病因的基因突变。

这里需要说明的是,全外显子测序其实会产生海量数据,发现的突变那是千千万万;因此需要筛选,就是根据已有的基因突变数据库,结合受检者的症状,挑出那些可能和症状有关的基因的突变放在报告里面。显然,基因突变数据库涵盖越全面,就越有机会抓出致病的基因突变(限于外显子和临近内含子)。

这份报告列出的两个基因突变,TRPM3(M1015I)和MAGEL2(R735H),到底哪个是致病元凶,还是两个都是,在这个阶段是很难做出结论的,但我们可以猜一猜。

先祭出Sfari自闭症基因数据库这个法宝。两个基因的名字丢进去,TRPM3返回零个结果,而MAGEL2则是1类高危基因。

那这个MAGEL2基因突变岂非相当可疑?但事情没那么简单。

MAGEL2基因比较特殊。和绝大部分基因不同,这个基因虽然位于第15号常染色体上面,但只有从父亲那里继承的那条MAGEL2基因能够正常工作,从母亲那里继承的那条MAGEL2基因,则被“封印”了,基本不起任何作用。

对此有印象的读者可能很快会联想到著名的“小胖威利”综合征和“天使人”综合征。事实上,MAGEL2基因就是导致“小胖威利”综合征的五条基因之一。。。这就是为什么MAGEL2基因被归类为一类高危基因的缘故了,因为“小胖威利”综合征患者大多数也有自闭症症状。

这里就有了一个问题。孩子携带突变的这条MAGEL2基因来自父亲,因此它肯定是在工作而不是被“封印”;如果该突变是致病原因,而父亲又携带同一个突变,那父亲岂非也会发病?根据报告,父亲是正常的,好像就可以排除这个推测了?

哎,就是有这么不巧的事情。

曾经有人发现一个病例,夫妻双方都正常得不得了,连接着怀里三个孩子,都在六七个月的时候胎死腹中。。。基因检测发现,三个胎儿都携带一种未曾知道的MAGEL2基因突变,导致该基因完全丧失了功能,因而胎儿未能幸存。稀奇的是,研究者在丈夫身上也检出了这个基因突变!

接着追下去,追到爷爷奶奶那一代,才发现原来是奶奶携带这个致命突变!然而奶奶的这条MAGEL2基因是封印的,另一条MAGEL2基因没问题,所以奶奶没有问题!然后儿子从奶奶这里继承了这条有问题的MAGEL2基因——当然是封印的,所以也没有问题;但孙子们却非常不幸运,他们从父亲那里继承的,都在这条有问题的MAGEL2基因!

所以,本文讨论的这个检测报告,只发现了孩子和父亲都有这个MAGEL2(R735H)突变,但并没有检测父亲的这个突变是处于封印状态还是处于工作状态,即是来自爷爷(工作)还是奶奶(封印)。如果来自爷爷,那基本可以推论出这个突变不具有致病性;如果来自奶奶,那就难以得出结论了。

Sfari自闭症基因数据库收录了迄今为止知道的47种致病MAGEL2基因突变,其中46种都是那种导致基因完全丧失功能的移码或截断突变,只有一种(A538E)是本文提到的这种错义突变(只改变了一个氨基酸),且患者同时携带另外三种疑似致病基因突变。

因此,这个MAGEL2(R735H)突变是不是致病原因,现在单靠测序是没法判断的。

再看TRPM3(M1015I)突变,虽然Sfari自闭症基因数据库没有收录TRPM3基因,但并不意味着这个基因发生突变不会导致自闭症相关症状,只不过是相关研究很新很少,2019年才有第一篇相关研究罢了。

TRPM3是一个大基因家族的一员,它的兄弟姐妹们编码一类TRP膜通道蛋白,负责感受温度、味觉、视觉、伤害等。。。看起来是不是和自闭症毫无关系。。。但事实上它们参与多种生理活动,出现问题后并不仅仅只有感觉会出现毛病。。。

在2019年的时候,有人研究了8位特殊的智力障碍兼癫痫患者,发现他们全部都TRPM3基因突变,并且其中7人携带同一种突变!

由于人们已经知道,两条TRPM3基因即使被拿掉一条也没有什么大的影响,因此目前的看法是,这些致病的TRPM3基因突变,它们并没有损害蛋白质的功能,反而是让这些蛋白质变得更加能干。。。

变得更加能干不一定是好事。。。假如你家的电闸变得更加敏感,一点点漏电都能感觉到,虽然非常能干能保护你永远不触电,却也会导致你家动不动就断电。。。这可不是你喜欢看见的。简单说,这就是TRPM3基因突变导致智力障碍和癫痫的原因。

在本文讨论的这个报告中,父母双方都不携带这个TRPM3(M1015I)突变,只有孩子携带,这说明该突变是一个新生突变;另外该突变位点虽然从来没有同样的报告病例,却和已知病例的突变点相当靠近;综合看来,致病嫌疑是不能排除的。

因此,该报告发现的两个基因突变,都有致病的可能,虽然TRPM3的嫌疑似乎大一点?除了请专家做进一步的生化实验判断外,椰菜君觉得,根据孩子目前的症状,医生和专家或许可以有个判断,因为这两个基因的相关症状差别似乎还是蛮大的。。。比如“小胖威利”的癫痫发病率并不高,且有很特殊的体型。。。另外TRPM3突变导致的癫痫,好像是有药可以试的。。。

最后再强调一下,上述浅显文字仅起科普作用,诊断必须咨询专家和医生。

本文不构成任何医疗建议,只提供观点。

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机构简称:钦州市妇幼保健院
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赵小乐
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人物性质:机构特教
所属单位:北京市大兴区翌晨孤独症儿童康复中心
人物特长:机构特教
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