在国内，目前尚无关于孤独症的系统的流行病学统计资料。如果根据孤独症的患病率大约为0.5%。而广泛性发育障碍患病率的保守报告约为1%。，以中国现有的总人口数来估计，中国目前可能有50万左右的孤独症患者，100万左右的广泛性发育障碍患者。有必要强调的是这一估计值是较为保守的，实际的患病人数可能更多。
2001年，中国首次将儿童精神残疾列入残疾儿童抽样调查范围，并组织了国内六省市0〜6岁残疾儿童的抽样调查。本次精神残疾的调查采用了中国精神疾病分类与诊断标准第三版（CCMD-III）和精神疾病诊断和统计手册第四版（DSM-IV）作为临床诊断标准，共抽样调査0〜6岁儿童60124人，筛出可疑精神残疾140人，确诊精神残疾61人，精神残疾现患率为0.101%。调查数据显示，孤独症发病率已居我国各类精神残疾之首，平均每500个儿童中就有一个是孤独症患者。据此推算，中国每年新增0〜6岁精神残疾儿童约为1.5万。根据2000年第五次全国人口普查的人口数推算，中国约有0〜6岁精神残疾儿童10.4万，其中孤独症患儿为10万左右。
另一个关于儿童孤独症患病率的信息是，根据2005年的数据统计，我国大约有1300万智障患者。由于孤独症与智力障碍在症状上存在某些交叉，在许多国家都一度将孤独症当作智力障碍诊断。据此推论，中国现有的智力障碍患者中，可能有相当一部分是孤独症患者。与其他国家相似，对我国孤独症流行病学确切数据的掌握，有待于科学研究的不断深入和孤独症测量诊断方法的进一步推广。
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