对MSSNG数据集的大规模更新使合格的研究人员随时可以在基于云的平台上探索自闭症的遗传结构。
迄今为止规模最大的对自闭症患者全基因组序列的分析将新基因和变异与这种疾病联系起来。研究结果和序列——来自5100名自闭症患者和6212名非自闭症患者——被放在一个基于云的平台上，供合格的研究人员使用。
这项努力是正在进行的MSSNG项目的最新进展，与2017年之前发布的研究合作相比，参与者人数增加了一倍。
它还扩大了所考虑的变异类型，包括遗传或非遗传，常见或罕见的单核苷酸变异;短插入和删除;结构变异;额外的重复DNA片段称为串联重复扩增;和线粒体DNA变异。
加拿大多伦多大学分子遗传学教授、首席研究员Stephen Scherer说，同时收集如此多不同类型变异的数据对广泛的自闭症研究人员来说是有用的，而且需要广泛的专业知识。100多名研究人员在这项研究中合作了大约两年。
Scherer实验室的博士后研究员布Brett Trost说:“如果你只是从名单中随机挑选两位作者，并考虑第一作者是否能够做到第二作者所做的事情，反之亦然，在大多数情况下，答案是否定的。”
其他自闭症遗传学家急切地等待着MSSNG的最新发布，位于达拉斯的德克萨斯大学西南医学中心的神经科学和人类生长与发育副教授Maria Chahrour说，她没有参与这项研究。根据这篇论文，截至7月，来自20个国家65个机构的300多名研究人员可以访问该数据库。研究结果发表在11月的《Cell》上。
来自只有一个自闭症儿童的单一家庭的近3500名自闭症患者，777名来自至少有两个自闭症儿童的多重家庭。四分之一的参与者是非欧洲血统。
自闭症与134个基因密切相关——其中67个以前没有报道过——在对MSSNG和另外两个项目(自闭症测序联盟和SPARK)数据中的从头编码变异进行分析后发现。许多新基因有助于自闭症的细胞功能，包括突触信号，染色质重塑和基因表达和蛋白质翻译的控制。SPARK由Spectrum的母公司西蒙斯基金会(Simons Foundation)资助。
在整个数据集中，大约14%的自闭症患者携带罕见的变异基因。该团队在Simons单纯型自闭症家族的9205人的序列中发现了类似的比例。该系列也由西蒙斯基金会(Simons Foundation)资助。
“我们对罕见的基因变异有了很好的了解，”Scherer说。“现在是时候关注其他85%的家庭发生了什么。”他补充说，这将需要研究数十万个家庭的整个基因组。
作为朝着这个方向迈出的一步，Scherer的团队计算了每个MSSNG参与者的自闭症多基因风险评分——与病情相关的常见变异的总和。研究小组发现，自闭症患者比他们的非自闭症兄弟姐妹得分更高，这与之前的研究一致。但来自多重家庭的自闭症患者的得分并不高于平均水平，这表明罕见的遗传变异在多重自闭症中发挥了更大的作用——这一发现补充了10月份美国人类遗传学学会会议上发表的一项未发表的多重家庭分析。
Chahrour说，多基因风险评分的新分析是一个重大贡献。
Chahrour说:“我认为，在我们知之甚少的情况下，夸大多基因风险评分是危险的，而且我们主要依靠欧洲血统来计算这些评分。”Chahrour自己的遗传学研究主要集中在祖先多样化的人群上。
这项研究还为数千个参与的家庭提供了信息。维姬·加巴特和丈夫有一个患自闭症的儿子杰弗里和一个没有自闭症的儿子卢克，加巴特说:“我们想知道这是否是我们传给杰夫的一种基因特征，以及这是否与他的兄弟有孩子有关。”
杰弗里的基因组显示了一种自发的从头的基因突变，这不是遗传自他的父母。
“我们知道什么都不会改变，”加巴特说，“但知道这是一个‘打字错误’，让我们安心了。”
参考文献
Massively parallel characterization of engineered transcript isoforms using direct RNA sequencing
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