作者 | JESSICA WRIGHT
编译 | RAY
编译者注：遗传学的研究范围包括遗传物质的本质、遗传物质的传递和遗传信息的实现三个方面。“遗传”二字不仅仅只限于大众对字面上的理解（遗传就是意味着上-下代的关系），遗传物质的传递与实现是2个不同的话题。比如：新生突变(De novo mutation)，又称自发性突变(spontaneous mutation)，是一种非遗传性突变，存在于儿童中，但不存在于其父母中；肿瘤就是当事人的基因变异，与父母无直接的关联性（但有可能有易感性）；表观遗传疾病是在基因信息表达时出了问题。研究发现，孤独症患者的不耐受基因的功能缺失突变是正常同胞的三倍。医学遗传学是一种在分子水平上研究疾病的代称。___RAY
许多基因在孤独症和发育迟缓中都发生了改变。有时候，被诊断为发育迟缓的人和被归类为孤独症的人之间可能没有什么区别。上图：(左)是调节基因表达的基因，(右)是影响神经信号的基因。
对近1.1万名发育迟缓或孤独症患者的自发性突变进行分析后发现，在一种或两种情况下共涉及253个基因；49个基因是新的候选基因。
这项研究汇集了来自两种诊断的个体的数据——这种方法增加了数据的数量，增强了关联的有效性。
首席研究员、西雅图华盛顿大学(University of Washington In Seattle)基因组科学教授埃文•艾奇勒(Evan Eichler)表示:“就更快地获得(候选)基因并将信息反馈给父母而言，我们应该更频繁地组合这些数据集。”
去年5月，在荷兰鹿特丹举行的2018年国际孤独症研究协会年会上，一个独立团队对来自近1.2万名孤独症患者的重叠数据进行了平行分析。该团队发现了99个与孤独症相关的基因。
这项新的研究还观察了被识别的基因是否存在于拷贝数变异(CNVs)中——DNA的大量复制或缺失——这些都与已知的大脑状况有关。研究人员在这些CNVs中发现了30个基因。
宾夕法尼亚州立大学生物化学和分子生物学副教授Santhosh Girirajan说，这种基因和CNVs的重叠“令人安心”，他没有参与这项研究。但是研究人员不应该排除这些 CNVs中的其它基因，他说。
基因位点
这项研究包括5624名孤独症患者、5303名发育迟缓患者及其父母们的基因序列。这些数据来自各种已发表的数据集，包括来自“发育障碍解密研究”的4000多名参与者。
研究人员比较了患有这种疾病的人和未受影响的家庭成员的基因序列，以发现自发产生的突变。然后他们使用了两种统计方法来强调那些可能导致这种情况的突变。
他们总共标记了253个基因的突变，包括124个强有力的候选基因；其中10名候选人之前从未与这两种情况有过联系。这项研究发表在1月份的《自然遗传学》杂志上。
这两种方法基本上是基于相同的基因，但并不完全一致。没有参与这项研究的华盛顿州立大学斯波坎分校(Washington State University Spokane)生物医学科学助理教授露西亚说，关注共享基因可能会有启发意义。
超过四分之三的基因在孤独症和发育迟缓中发生突变。其中5种与智力障碍和发育迟缓关系更密切：包括ARID1B和ANKRD11。虽然CHD8、DSCAM和WDFY3都显示出这方面的统计趋势，但没有一个是孤独症独有的。
Girirajan说，由于孤独症通常与许多其他疾病并存，所以识别孤独症特异性基因变得复杂。他说，有时候，被诊断为发育迟缓的人和被归类为孤独症的人之间可能没有什么区别。
突出显示的基因倾向于（1）调节其它基因的表达、（2）神经元之间的通讯和细胞信号传导。许多表达发生在胎儿早期到中期发育，这是孤独症风险的关键时期，以及在多种类型的神经元中。
该分析还强调了特定CNVs中的基因，如16p11.2区域的MAPK3，与孤独症密切相关。
哈佛大学(Harvard University)神经学副教授迈克尔•塔尔科夫斯基(Michael Talkowski)表示，这些发现“有力地支持”这样一种观点，即许多CNVs是通过单个基因发挥作用的。塔尔科夫斯基没有参与这项研究。
研究人员的目标是在获得更多的测序数据后重复这一分析。在今年10月举行的2018年美国人类遗传学学会会议上，来自“发育障碍解密研究”的研究人员展示了另外26765个家庭的初步数据。
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