到目前为止，孤独症的治疗没有特效药，有些药物的合理使用在控制儿童行为问题方面（如：兴奋、冲动、自伤、磨眠障碍等）取得了一定的效果，但这些药物对于孤独症儿童的主要问题，如社会交往及沟通能力不能起到康复治疗作用。所以孤独症的康复干预方法还是以康复教育训练为主。
可以将各种孤独症疗法分为以下5类：
①以技巧发展为基础的干预：
应用行为分析法（ABA）、图片兑换沟通系统（PECS）、人际关系本位的介入（RelationalDevelopmentIntervention,简称RDI）、社交故事。
②S于生理学的干预疗法：
感觉统合、听觉统合，膳食与生物医学疗法。
③以促进人际关系为基础的疗法：
地板时光、Sun-Rise方案。
④结构式教学。
⑤其他方法：
如语言治疗、职业治疗、音乐治疗等。
早期诊断和早期干预可以改善孤独症的预后，全世界已建立了许多孤独症特殊教育和训练课程体系，但众多的训练方法各有优缺点，尚无证据表明，哪一种显著优于其他方法，目前各种方法亦有互相融合的趋势。
对于康复技术人员来说，应该熟悉并掌握多种康复方法，根据儿童的测评结果与需要采取合理的康复手段，可以是多种方法的组合使用。任何一种为大多数人认可的康复方法都是为了解决孤独症儿童的主要问题，达到同一个目标，即提高社会生活技能，融入主流社会。
目前主要的康复方式为：机构康复、家庭康复、社区康复。
机构康复：
能建立一支由特教教师、心理治疗师、语言治疗师、感觉统合训练师、音乐教师、社会工作者和家长等组成的康复团队，具备先进齐全的测评工具，构建有多间拥有各种康复功能的工作室，可以对孤独症儿童进行精细评估测试，并做出合理的分析，制定细致的康复计划安排和科学的操作。此方式为孤独症儿童的首选。
家庭康复：
家长是孩子的第一任教师，家庭是孩子终身的学校。利用孩子熟悉的家庭环境和贴身照料的家长教育，对孤独症儿童在熟识的日常生活中进行康复极为方便与实用。家庭康复教育和训练必须是在借助了专业机构的评估测试下，制定合理康复计划，大量学习康复知识，掌握康复技巧，学会观察和分析孩子后，在专业人员的指导下进行。
社区康复：
选择孤独症儿童生活环境周围的社区资源，加以合理利用，符合康复的就近、便利原则。如，孤独症儿童在社区生活环境中如何利用社区设施，进入社区的幼儿园进行融合教育等。在参加社区康复中也需要有社区专业康复指导进行，特别是在融合教育中，普通幼儿教师要了解孤独症儿童的特点，并给予个别化的支持。
孤独症儿童的康复要在专业机构、家庭、社区紧密的配合下才能达到回归主流社会的最终目标。专业机构的专业人员对儿童进行全面康复治疗的同时要注重对家长的培训，提高家庭成员对孤独症孩子的认识，让他们及时掌握技能、技巧，帮助其改善家庭教育和生活环境，缓和家庭紧张气氛。同时需做好社会宣传工作，提高社会对孤独症儿童的认识，使社会能提供给孤独症儿童家庭社会支持，理解、接纳他们，维护孤独症儿童平等享受生活、参与学习的权力。
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