随着工业和农业的发展，人们要释放大约80000种化学物质到自然环境中，其中约1000种具有神经毒性，还有许多化合物的毒性处于未知状态。其中已知的神经毒性物质主要有空气污染物、重金属、有机污染物、杀虫剂等。
有文献报道，孤独症患者的红细胞中铅和汞的水平显著增高，血液中铅水平显著高于对照组。
另外，基于大人群的病例对照研究发现，孤独症患者在关键期（怀孕前三个月、怀孕期、出生后一年）的农药暴露比例要高于对照，毒死蜱、二嗪农、阿维菌素与孤独症的关联性最强，产前暴露于草甘膦、阿维菌素等农药的后代患孤独症的风险存在小到中等程度的增加，同时婴儿期农药暴露可能导致更严重的孤独症症状并增加智力障碍的风险。
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