阿斯伯格综合征和自闭症儿童都存在一些运动障碍，这不仅体现在上体育课时粗大动作完成不佳，还体现在一些精细动作的笨拙上。
运动问题虽然不是自闭症特征中的一部分，但是这方面问题在自闭症儿童中并不少见。常见的问题有运动障碍，它会使运动计划十分困难，而且不管在精细动作计划、粗大动作计划，或是在口头动作计划中，运动障碍都会有所体现。即使运动能力优秀，运动障碍也会让学习新任务变得困难。
自闭症儿童在运动能力方面会遇到的常见同题包括：平衡能力困难（可能是因为前庭感官系统的干扰）、行动笨拙、踮脚行走。另外，家长们从发育角度也发现，自闭症儿童在运动能力发展的转折点上出现滞后，学会坐起、爬行以及走路都要慢。精细动作问题包括不会使用剪刀裁剪，书写笔迹较差等等。老师和家长常会注意到这些问题，在自闭症治疗过程中也在不停地帮助矫正。当然，运动障碍不是自闭症的定义特点，也不是所有人都有显现。
调查显示，阿斯伯格综合征儿童在精细动作协调和粗大动作协调方面存在很大困难，有着粗大动作缺陷的儿童经常被骂太笨。阿斯伯格综合征儿童会觉得体育课十分困难，因为他们在需要协调能力的运动项目上做得并不出色。例如，接球或者单脚独立对他们来说十分不容易。当一个孩子既有社交缺陷，运动能力又有所欠缺的时候，就不难理解为什么很多阿斯伯格综合征儿童会不爱写字。
同样地，阿斯伯格综合征儿童的手工灵敏度通常也较差，同时使用双手对于他们来说是个挑战。像系鞋转这样看起来简单的事情，对于一名阿斯伯格综合征儿童来说也是个巨大的挑战。这些孩子们样需要十分努力，才能学会骑自行车或者滑旱冰等运动项目。
阿斯伯格综合征和自闭症儿童的运动障碍并不是永久性的，只要通过科学的干预训练，这些缺陷就会得到缓解，至少不再影响他们的正常生活。
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