孤独症患儿常表现出感知觉异常，即过分敏感或迟钝。
有的患儿对疼痛感非常麻木，对于危险和伤害没有躲避和呼救的能力，因此常常受伤；
有的患儿对声音、光线过分敏感，一点小声就要捂上耳朵，或只能眯着眼睛看光；
有的患儿味觉迟钝；
有的则有很好的平衡能力或听力。
特殊的感知觉使得他们中的一些人具备特殊的才能，如高超的音乐、绘画、机械记忆或计算能力等。
多数孤独症儿童在8岁前存在睡眠障碍，约80%的患儿伴有精神发育迟滞，60%的患儿IQ低于50，20%的儿童IQ在50-70之间，只有20%达到了70以上气由于他们的言语交流能力差，不肯合作，为智力评估工作的进行增添了很多困难。
调查显示，64%的患儿存在注意障碍，36%〜48%的患儿存在过度活动，6.5%〜8.1%的患儿伴有抽动秽语综合征，4%〜42%的患儿伴有癫痫，2.9%的患儿伴有脑瘫，4.6%的患儿存在感觉系统的损害，17.3%的患儿存在巨头症。这些症状的岀现在一定程度上增加了孤独症治疗的难度。
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