许多患有自闭症谱系障碍的儿童有“过敏症状”家族史和/或个人史，这些过敏症状可能是肥大细胞被错误的激活。此外，患有肥大细胞增多症或肥大细胞激活综合征的儿童患自闭症谱系障碍的比例高出正常儿童10倍。而过敏、感染、环境（尤其是在围产期）触发肥大细胞会释放促炎因子和神经毒素。可能破坏肠道和血脑屏障，从而导致脑部炎症和自闭症的发病机制。
（肥大细胞：异常触发会释放促炎因子，免疫系统的哨兵，释放不同物质杀死病原体，释放蛋白酶降解毒素）
季节变化和自闭症儿童“过敏症状”
研究表明，自闭症儿童的行为问题发生了显著的变化，在4月中旬出现恶化，就是在过敏季节高峰或“过敏症状”严重时，自闭症行为问题会严重。其他研究结果提示，自闭症可能有功能紊乱失调的免疫系统。
一项关于儿童自闭症和过敏的病例对照研究也体现了这一点。使用健康记录来检查44种“免疫相关疾病”与自闭症谱系障碍的关联；在妊娠中期，母亲患牛皮癣、哮喘、花粉热和特应性皮炎的高发率与孩子患自闭症的风险增加两倍以上。
图1过敏和非免疫触发在自闭症发病的机制中肥大细胞激活可能参与的示意图
围产期肥大细胞激活，作为对过敏或不是免疫触发造成的反应，可能会破坏肠道和血脑屏障，并允许神经毒素进入大脑，导致脑部炎症，从而导致自闭症谱系障碍的发病机制。（图2）
具有超敏肥大细胞更容易对环境和压力诱因做出反应，从而导致自闭症谱系障碍的加剧或恶化。在研究中肥大细胞相关的触发因子和介质极为重要，尤其是在接近诊断的时候。这些可能有助于揭示自闭症发病机制的新方面，识别潜在的生物标志物，以及建立新的治疗靶点。
与此同时，阻断肥大细胞的异常激活可能被证明对减少“过敏样”症状和可能的自闭症相关行为都是有用的。
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